Referensmetodik: Tarminfektioner

Från Referensmetodik för laboratoriediagnostik

Redaktör för wikiupplagan av denna bok är Sven Löfdahl, avdelningen för bakteriologi, Smittskyddsinstitutet, 171 82 SOLNA.

Innehåll 1 Innehåll 2 Allmän del 2.1 Epidemiologi 2.2 Provtagning 2.3 Kvalitetssäkring 2.4 Säkerhetsaspekter 2.5 Smittskyddslagen 3 Speciell del 4 Bakterier 4.1 Utodling 4.2 Bakterier associerade med tarminfektioner 4.3 Matförgiftningar 4.4 Översikt 5 Parasitologi 6 Virus 7 Bilagor

Innehåll

• Förord, infektioner i mag-tarmkanalen

Allmän del

• Anatomi och sjukdomsbegrepp
• Normalflora i mag-tarmkanalen
• Rubbningar i normalfloran

Epidemiologi

• Epidemiologi och prevention
• Speciell epidemiologi
• Etiologi vid akut gastroenterit i Sverige

Provtagning

• Provtagning och transport

Kvalitetssäkring

• Kvalitetssäkring

Säkerhetsaspekter

• Säkerhetsaspekter

Smittskyddslagen

• Smittskyddslagstiftningen och dess tillämpningar

Speciell del

Bakterier

Utodling

• Utodling (Salmonella, Shigella, Yersinia, Campylobacter)
• Resistensbestämning

Bakterier associerade med tarminfektioner

• Salmonella
• Shigella
• Yersinia enterocolitica och Yersinia pseudotuberculosis
• Campylobacter
• Diarréframkallande Escherichia coli
• Enterohemorragiska Escherichia coli (EHEC)
• Vibrio cholerae
• Övriga Vibrio, Plesiomonas och Aeromonas
• Helicobacter pylori
• Clostridium difficile

Matförgiftningar

• Matförgiftningar-allmänt
• Bacillus cereus
• Clostridium perfringens
• Staphylococcus aureus
• Clostridium botulinum

Översikt

Diagnostik odling-mag tarm (Tabell)

Parasitologi

• Intestinala protozoer
• Utredningsplan för påvisande av parasiter i feces
• Blastocystis hominis
• Balantidium coli
• Cryptosporidium spp
• Cyclospora cayetanensis
• Dientamoeba fragilis
• Entamoeba histolytica
• Giardia intestinalis
• Isospora belli
• Microsporidia

Virus

• Virala tarmpatogener
• Rotavirus
• Calicivirus
• Astrovirus
• Enteriska adenovirus

Bilagor

• Bilaga 1a. Bakteriologiska referenssubstrat
• Bilaga 1b. Substratkontroll
• Bilaga 2. Bakteriologiska referensmaterial
• Bilaga 2b. SMI-utskick: Salmonella-S1-10/2002
• Bilaga 3. PCR-diagnostik av diarréframkallande E coli och EHEC
• Bilaga 4. Virologiska metoder
• Bilaga 4b:RT-PCR för detektion av Norwalk-liknande humant calicivirus
• Bilaga 5. Clostridium difficile-cytotoxin;analysprocedur
• Bilaga 6. Parasitologiska metoder